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水稻OsLecRK基因RNAi载体的构建及遗传转化

时间:2022-04-13 08:56:59 浏览次数:

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1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 供试品种 供试水稻品种为合江19,购自国家种质资源库,以下简称H1493。

1.1.2 质粒与菌种 大肠杆菌(E. coli)DH5α和农杆菌EHA105。所使用的载体包括pCAMBIA1301载体、pCU载体和pKANNIBAL载体,载体购自宝生物工程(大连)有限公司。

1.1.3 工具酶及主要试剂 限制性内切酶BamHⅠ、XhoⅠ、EcoRⅠ、XbaⅠ、HindⅢ、pMD19-T 载体、T4 连接酶购自于宝生物工程(大连)有限公司。试剂:蛋白胨、酵母提取物、氨苄青霉素、卡那霉素等抗生素购自于Sigama公司;Taq DNA polymerase、pfu DNA polymerase、dNTPs、DNA凝胶回收试剂盒等购自康为世纪生物科技(北京)有限公司;质粒小量快速提取试剂盒、核酸分子量 Marker 购自天根生化科技(北京)有限公司; 其余常规药品均为进口或国产分析纯。引物合成和测序由北京奥科生物技术有限公司完成(表1)。

1.2 方法

1.2.1 目的基因的获得 采用小量DNA提取方法提取水稻品种B5基因组 DNA。以B5基因组 DNA 为模板,OsLecRKXE和OsLecRKXH为引物,分别扩增两段OsLecRK 基因530 bp的顺式和反式片段。PCR反应体系:10×PCR反应缓冲液2 μL,dNTPs(2.5 mmol/L)2 μL,MgCl2(25 mmol/L)2 μL,Taq DNA 聚合酶0.2 μL,上、下游引物(10 μmol /L)各 0.5 μL,DNA模板0.5 μL,ddH2O补足至20 μL。PCR反应程序: 94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s, 56 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,35个循环;72 ℃延伸10 min。将其PCR产物分别进行回收,回收片段经加尾 polyA后与克隆载体 pMD19- T载体连接,构建重组质粒,然后将其转化大肠杆菌DH5α。

1.2.2 RNAi重组载体的获得 扩增靶标片段连入pMD-19T载体测序正确后,从pMD19-T载体上使用XhoⅠ+EcoRⅠ双酶切切下顺向靶标片段(OsLecRK)并连入pKANNIBAL载体,构成载体pKAN- OsLecRK XE。同样从pMD19-T载体上使用XbaⅠ+HindⅢ双酶切切下反向靶标片段OsLecRK连入载体pKAN-OsLecRK XE,构成重组载体pKAN-(OsLecRK)2。目的片段以相反的方向克隆到pKANNIBAL载体的两个多克隆位点接头中,中间被Pdk内含子隔开,即形成dsRNAi片段。最后利用BamHⅠ酶切载体pKAN-(OsLecRK)2得到所需的dsRNAi片段,连入经BamHⅠ酶切的pUC载体,构成RNAi载体。

1.2.3 转基因水稻的获得鉴定 将构建好的重组质粒转化农杆菌EHA105,在含有50 μg/μL卡那霉素和50 μg/μL利福平的平板培养基上筛选,单菌落以OsLecRKXE为引物进行PCR鉴定。将鉴定正确的单菌落进行摇菌,待菌液为OD600 nm约0.5时,侵染预先培养好的日本晴愈伤组织,28 ℃暗培育2.5 d;将愈伤组织挑出放入无菌三角瓶中,用含500 mg/L头孢拉定的无菌水清洗干净;晾干后放入含500 mg/L潮霉素培养基上筛选15 d,共筛选2次;将培养基上能增生分裂的抗性愈伤组织转入分化培育基上,一周后愈伤组织开始转绿;将其转到装有分化培育基的三角瓶中,约3周后,愈伤组织长出嫩芽并生根;待根部发育粗壮、苗高约6~10 cm时,打开瓶盖进行炼苗;一周后移栽大田。

1.2.4 转基因水稻的鉴定 提取水稻的总DNA,具体步骤按试剂盒说明操作。以Hyg-F/Hyg-R为引物对进行抗性基因检测,PCR反应体系为:10×PCR反应缓冲液2 μL,dNTPs(2.5 mmol/L) 2 μL, MgCl2(25 mmol/L)2 μL,Taq DNA 聚合酶0.2 μL,上、下游引物(10 μmol /L) 各0.5 μL,质粒1 μL,ddH2O补足至20 μL。PCR反应程序为:95 ℃预变性4 min;94 ℃变性30 s,55 ℃退火45 s,72 ℃延伸50 s,30个循环;72 ℃延伸10 min。

2 结果与分析

2.1 RNAi干扰片段的克隆

以模式抗虫水稻品种B5 mRNA为模板,采用RT-PCR 扩增(NCBI accession number:Os04g 12560)

靠近翻译起始位点ATG带有特定限制性酶切位点的530 bp长的正反义片段,结果与预期片段大小相符(图1)。

2.2 OsLecRK RNAi载体的构建

分别选择OsLecRK基因编码区的530 bp作为该基因的目的片段,用于构建RNAi载体转化水稻。OsLecRK使用正向引物带有XhoⅠ+BamHⅠ酶切位点和反向引物带有EcoRⅠ酶切位点扩增靶标片段,连入pMD19-T载体测序正确后,从pMD19-T载体上使用XhoⅠ+EcoRⅠ双酶切切下靶标片段OsLecRK并连入pKANNIBAL载体,构成载体pKAN-OsLecRKXE(图2)。

然后再使用正向引物带有XhaⅠ+BamHⅠ酶切位点和反向引物带有Hind III酶切位点扩增靶标片段,pMD19-T载体测序正确后,从pMD-19T载体上使用XbaⅠ+Hind Ⅲ双酶切切下靶标片段OsLecRK连入载体pKAN-OsLecRKXE,构成载体pKAN-(OsLecRK)2(图3)。

目的片段以相反的方向克隆到pKANNIBAL载体的两个多克隆位点接头中,中间被Pdk内含子隔开,获得pKAN-OsLecRK-RNAi的中间表达载体。使用BamHⅠ酶切载体pKAN-(OsLecRK)2,得到dsRNAi片段,连入经BamHⅠ酶切的pCU载体,构成RNAi载体(OsLecRK-RNAi)(图4)。

2.3 转基因植株的获得

利用农杆菌介导的遗传转化方法,将构建好的RNAi载体(OsLecRK-RNAi)利用电转化的方法导入农杆菌菌株EHA105中,以粳稻品种合江19为受体进行遗传转化水稻。以靶标基因和潮霉素设计引物,通过PCR进行鉴定OsLecRK-RNAi(图5),获得OsLecRK-RNAi阳性转化植株。

3 小结与讨论

RNA干扰(RNA interference, RNAi)技术是反向遗传学重要的试验技术手段之一,具有特异性和高效性,是研究基因功能的有效途径之一[6],它的应用为阐明基因生物学功能提供了有利的工具。相关研究表明,有效的靶基因片段对 RNA干扰的成功非常重要,基因片段长度在 23~1 000 bp间都能获得良好的沉默效果[7]。

为了研究和验证OsLecRK基因的生物学功能,通过反向遗传学的方法,敲除水稻OslecRK基因,构建了RNAi抑制转基因株系,为进一步研究奠定基础

参考文献:

[1] KHUSH G S. Origin,dispersal,cultivation and variation of rice[J].Plant Mol Biol,1997,35(1-2): 25-34.

[2] WAN J, PATEL A, MATHIEU M,et al. A lectin receptor-like kinase is required for pollen development in Arabidopsis[J].Plant Molecular Biology,2008,67: 469-482.

[3] CHEN X,SHANG J,CHEN D,et al. A B-lectin receptor kinase gene conferring rice blast resistance[J]. The Plant Journal, 2006, 46:794-804.

[4] XIN Z,WANG A,YANG G,et al. The Arabidopsis A4 subfamily of lectin receptor kinases negatively regulates abscisic acid response in seed germination[J]. Plant Physiology, 2009,149:434-444.

[5] DENG K,WANG Q,ZENG J,et al. A lectin receptor kinase positively regulates ABA response during seed germination and is involved in salt and osmotic stress response[J]. Journal of Plant Biology, 2009, 52:493-500.

[6] MIKI D, ITOH R, SHIMAMOTO K. RNA silencing of single and multiple members in a gene family of rice[J]. Plant Physiology, 2005, 138(4): 1903-1913.

[7] WESLEY S V, HELLIWELL C A, SMITH N A ,et al. Construct design for efficient, effective and high-throughput gene silencing in plants[J]. Plant Journal, 2001, 27(6):581-590.

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