农产品副产物是在农产品生产或加工时产生的非主产品，包括秸秆、米糠、稻壳、麸皮、饼粕、果渣、菜帮、畜禽骨血、薯渣、酒糟、醋糟等。2013年，我国农作物秸秆约8亿吨，占农业生物质总产量的50%；粮油、果蔬、畜禽、水产品加工副产物5.8亿吨，其中60%（远低于发达国家的10%）被作为废物丢掉或简单堆放简，形成秸秆、稻壳、酒糟、果渣、菜帮、骨血等农产品副产物的几座“大山”。相当于7亿亩土地的投入产出和6000亿元的收入被损失掉。
农产品综合利用的现状
粮食加工综合利用率很低。目前，粮食加工副产物1.8亿多吨，其中米糠2042万吨，稻壳4085万吨，麦麸2178万吨，玉米芯4000万吨，玉米皮4112万吨，糟类1800万吨（酒糟1500万吨、醋糟300万吨），其中米糠、稻壳、米胚产量三项年均增长1.6%，麦麸、小麦胚产量同比增长3.1%；玉米芯、玉米皮产量年均增长6.7%。稻壳不足5%，碎米为16%，米糠不足10%，以碎米为最高，稻壳为最低。
油料加工综合利用率较低。目前，油料加工副产物9000万吨，年均增长3.9%，其中皮壳1000多万吨，饼、粕、油脚、皂脚等8000多万吨，综合利用率达到20%以上。
果蔬加工综合利用率最低。目前，果蔬加工副产物2.4多亿吨，同比增长4.4%，其中叶、秧、茎、根、皮、渣等21265万吨，皮、渣、籽、壳、核等3021万吨（柑橘1584万吨，苹果1155万吨，葡萄264万吨），综合利用率不到5%。
畜禽水产综合利用率稍高。畜禽屠宰加工副产物主要有骨、血、内脏、羽毛、皮毛等，产量总计5620万吨，同比增长5.4%。水产品加工副产物主要有头、皮、尾、骨、壳等，副产物总计1569万吨，同比增长5.4%。综合利用率畜类为29.9%，禽类为59.4%，水产为50%以上。
农产品加工副产物综合利用率低的负面影响巨大
浪费了资源。我国农产品加工综合利用率只有40%，而发达国家达到90%，其中日本则米糠综合利用率达到100%，即使欠发达的印度也达到了30%。副产物中丰富的碳水化合物、蛋白质、脂肪和其他有效物质，是食品、药品、保健品、能源、化工产品等原料，综合利用率低直接导致产品附加值较低，大量的资源没能物尽其用，白白地被浪费掉。
污染了环境。我国每年产生的农产品生产及加工副产物近14亿吨，由于这些副产物污染事故与事件逐年增加，近年来越来越值得关注。如秸秆焚烧增加了空气污染指数并影响到交通和航空运输事业；一些加工企业周边污水横流、臭气熏天，严重影响生态环境及景观、居民的日常生活和身体的健康，直接导致面源污染和水体富营养化；畜禽副产物中一部分不宜食用的副产物（骨、肺、腺体、胰脏等）及薯类淀粉生产的薯渣等副产物被排放或丢弃，排入城市下水道、河流、湖泊、海洋、废弃井矿、采石场或山洞等，污染水体，导致水生物死亡，还会产生臭气，影响居民生活；蔬菜主产区、大型蔬菜集贸市场及加工厂的菜帮堆积如山，腐烂变质，严重污染土壤、地下水和环境等，耗费大量资金来治理环境污染问题。
降低了收入。如把我国8亿吨的秸秆以50%作为能源加工，就相当于再建一个大庆油田；把30%的秸秆和5.1亿多吨粮油果菜副产物的70%作为饲料，按照每亩生产干苜蓿1吨计，相当于新增土地5.8亿亩。按照2012年大庆生产4000万吨原油和33亿立方米天然气（每吨原油按4005元，每立方米天然气按2.05元）及当年的苜蓿产量和价格（干苜蓿每吨1000元）计，产值为7469.65亿元，这些大都可以变成经济效益和农民收入。
增加了食物安全隐患。我国用世界7%的耕地养活了22%的人口，粮食保障已成为关系到国家安全的重要战略。国家粮食安全战略要求我国粮食的主要品种自给率必须在90%以上，方可保持国家粮食安全。要达到这一要求就必须进一步依靠科技，持续不断地提高粮食生产的土地产出率、资源利用率、劳动生产率和科技贡献率。但我国副产物的有效利用率低，没能为人们提供更多的食物能量和食物营养，影响到食物有效供给和国家粮食安全。
上述问题原因剖析
创新能力差。我国综合利用环节技术和装备水平普遍低于农产品加工环节，产品稳定性差，关键装备的对外技术依赖度高，副产物加工技术产业化程度低，专业方面人才缺乏系统培养和激励机制。
标准化管理不足。绝大部分综合利用产品没有制定国家标准和行业标准，更谈不上基础标准、方法标准和管理标准对产品标准的有效支持；综合利用生产的食品、保健品等投放市场后碰到了诸多的营销困难。
集群化程度不够。企业规模小而散，加工副产物或下脚料不集中，而进入市场环节和餐饮环节的废弃物又不能很好的回收、加工利用，无法进行加工副产物的规模化加工利用。