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一种木本植物RNA和DNA的简捷提取方法

时间:2022-04-08 08:11:03 浏览次数:

摘要:将尾叶按(Eucalyptus urophylla)叶片在液氮中研磨成粉,先用含山梨醇、聚乙烯吡咯烷酮(PVP)、牛血清白蛋白、聚乙二醇和亚精胺的提取缓冲液使总核酸沉淀,同时去除了大部分次生代谢物质。然后用山梨醇、月桂酰肌氨酸钠进一步裂解细胞,释放核酸。再用CTAB与核酸结合成复合物溶于高盐溶液。用氯仿/异戊醇除蛋白质后,离心得含总核酸的上清液。运用钙盐分步沉淀法,先在上清液中加入1/10体积的10%氯化钙溶液,使DNA与Ca2+结合成DNA钙盐。向溶液中加入1/5体积的乙醇,使DNA钙盐形成沉淀析出,离心得DNA后,再增大乙醇浓度使RNA钙盐沉淀。得到的DNA和RNA用非变性琼脂糖凝胶进行质量检测,可得完整的RNA和DNA条带。此法经济、快捷,可同时得到DNA和RNA。

关键词:木本植物;RNA;DNA;非变性琼脂糖电泳

中图分类号:075 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2010)04-0773-03

木本植物的组织中含有较多的多糖及单宁、酚、醌、原花色素类物质等次生代谢物质。这些物质严重影响木本植物RNA和DNA提取效率,甚至造成提取失败而成功提取高质量的RNA和DNA是进行分子生物学研究的必要前提,如Nofthera杂交分析、cDNA文库构建、RT—PCR、Southern杂交分析等实验都需要高质量的RNA或DNA。常用于植物RNA或DNA提取的方法有异硫氰酸胍法、热硼酸法、CTAB法、SDS法等。这些方法对于某些植物的核酸提取是有效的,但对另外一些植物来说,却并不一定是好的方法。对于木本植物而言。由于其次生代谢物质含量丰富,这些物质的化学性质又与核酸相似,所以提取过程中,次生代谢物质会严重干扰核酸的提取,影响核酸的得率及质量,甚至导致提取失败。

目前,常规的核酸提取方法或使用的试剂盒大多是针对单独的RNA或DNA的提取。用常规方法常易失败,而试剂盒不仅价格昂贵,而且适用于木本植物的试剂盒更是很少。

目前,文献中还没有报道用同一材料同时得到分离的RNA和DNA用于不同方面研究的报道。本研究以此为出发点,尝试从木本植物中同时得到分离的RNA和DNA,并通过琼脂糖电泳检测所提核酸的完整性。

1 材料与方法

1.1 植物材料

尾叶桉新鲜叶片。

1.2实验试剂

提取缓冲液:50 mmol/L Tris(pH值8.0)、35mmol/L山梨醇、5 mmol/L EDTA、10%(W/V)聚乙二醇4000、5%(W/V)聚乙烯吡咯烷酮(PVP)、0.2%(W/V)亚精胺和0.1%(W/V)牛血清白蛋白。洗涤缓冲液:50mmol/L riffs(pH值8.0)、35mmol/L山梨醇、25 mlil01/L EDTA。氯仿/异戊醇(24:1,V/V)、10%(W/V)月桂酰肌氨酸钠、5m01/L NaCl、含NaCl0.7mol/L的10%(W/V)CTAB、无水乙醇、70%乙醇、IO%CaCl2、TE或无菌水、1xTBE、Gold View核酸染料。

1.3 RNA和DNA的提取

称取约100mg新鲜尾叶桉叶片,在液氮中研磨成细粉后转移到2mL的离心管中:加入1.5mL提取缓冲液,颠倒混匀,3 000xg离心10 min;去上清,将沉淀悬浮于0.5 mL洗涤缓冲液中,依次加入10%月桂酰肌氨酸钠150 o,L、5 mol/L NaCl 150 txL、8.6%(W/V)CTAB和0.7 mol/L NaCl 200 IxL,混匀后65℃水浴20-30min;取出离心管自然冷却,加入l mL氯仿/异戊醇(24:l,V/V)混匀、静置5 min后,14 000xg离心10min;转移上清至新管,加入1/10体积的10%氯化钙溶液。混匀后静置5 min,再加入1/5体积无水乙醇静置10min后,12 000xg离心5rain;将上清转移至新管,DNA沉淀暂时保存。向上清中加入1.7倍体积的无水乙醇,静置20 min,12000xg离心5min。去上清,得RNA沉淀;分别用l mL 70%的乙醇洗涤上述沉淀,12 000xg离心5min。去上清,在超净工作台上晾干后加20μL TE溶解。CTAB法提取核酸参照王关林等的方法。TaKaRa公司RNiso试剂提取RNA方法参照说明书进行。叶片用量都为100 mg,最后都加20μrL TE溶解。

1.4 RNA和DNA电泳检测

配制1.0%琼脂糖凝胶,按100mL加入5μL的比例添加Gold View核酸染料。上样量2μL。电泳缓冲液为1xTBE,5V/cm恒压电泳1 h。电泳结束后在紫外灯下用数码相机照相。

2 结果与分析

非变性琼脂糖凝胶电泳检测RNA和DNA的质量,结果如图1所示。泳道1中DNA条带亮度低,RNA呈扫帚状,无明显条带。说明CTAB法很难从富含多酚的木本植物中提取核酸。泳道2为本方法提取的总核酸,DNA条带亮度高,RNA可见有明显的28S、18S和5.8S rRNA条带,且28S条带的亮度约为18S条带亮度的两倍。说明此方法得率高,RNA完整、无明显降解。泳道3为本方法从总核酸中沉淀的DNA。与总核酸泳道(泳道2)中的DNA相比,条带亮度减弱,说明DNA沉淀不完全。但泳道中无RNA片段,说明DNA从总核酸中完全分离,纯度高,无RNA污染。泳道4为本方法从总核酸中沉淀的RNA。与总核酸泳道(泳道2)中的RNA条带相比,条带亮度减弱,说明RNA沉淀不完全。同时,泳道中仍有极少的DNA,进一步证实了分步沉淀时,DNA没有完全沉淀出来。但泳道4中28S、18S和5.8S rRNA条带明显可见,证明提取的RNA降解少,片段完整。泳道5为用专门的木本植物RNA提取试剂RNiso提取得到的RNA,其带型及亮度与泳道4几乎完全相同,也有少量残留的DNA,说明此试剂提取RNA的得率和纯度与本方法一样。

3 讨论

本方法从木本植物桉树叶片中同时分离得到了RNA和DNA,并用非变性琼脂糖电泳检测了所提核酸的完整性。常规的RNA提取方法,如异硫氰酸胍法、RNiso试剂法,不仅需要苛刻的实验条件,而且所用的试剂含有重金属、酚、胍、强变性剂等污染环境的物质。另外,实验花费也相当大。本方法用常规试剂可以从木本植物中同时分离到完整的RNA和DNA,总核酸降解少,提取效率较高。虽然RNA中有少量DNA污染,但这是专业试剂也难以避免的现象,可通过加入DNase除去。本方法经济快捷,又避免了使用β-巯基乙醇、DEPC、溴化乙锭和甲醛等毒性大的试剂,减少了对实验操作人员的毒害及对环境的污染,具有较好的经济效益、生态效益和开发前景。

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