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PubMed的循证中医药文献检索研究

时间:2022-03-12 08:51:56 浏览次数:


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摘要:文章介绍了利用PubMed数据库检索循证中医药证据时的检索技巧和四种有效而快捷的检索方式,并结合实例分析各方式的检索特点,以期为循证中医药研究人员检索PubMed时提供参考。

关键词:PubMed;循证医学;中医药;检索

中图分类号:R2-03

Abstract:This paper introduces the search tips and foureffective andefficientways to usePubMedto retrieveevidenceof evidence-based traditionalChinese medicine, use retrieval case to analyzethe characteristic ofeachway,in order toprovide references to evidence-basedtraditional Chinesemedicineresearchersretrieve inPubMed.

Key words:PubMed;Evidence-based medicine;Traditional Chinese Medicine;Retrieval

循证医学(evidence-based medicine,EBM)是国际临床领域20世纪90年代诞生的一种新医学模式,是指在临床决策时需要慎重、准确、明智的应用当前所能获得的最佳证据,结合临床医生的个人专业技能和多年临床经验,同时考虑患者的权利、价值和期望[1]。循证医学从诞生至今短短二十几年,在国际医学领域得到了迅速发展,也得到了国内外中医药界的高度重视,越来越多的研究人员将循证医学的思想理念引人了中医药的临床研究之中。循证中医药研究步骤是:提出拟解决的问题→检索证据→评价证据→应用证据→后效评价,检索证据是循证中医药研究的第二个步骤且必不可少,证据检索的好坏最终影响临床决策,循证中医药的证据检索跟一般的中医药文献检索有一定区别,主要因为循证中医药的证据是以患者为研究对象的各种临床研究所得到的结果和结论,通常不包括体外细胞实验、离体器官的研究和动物试验[2]。本文探讨世界著名生物医学数据库PubMed的循证中医药文献检索。

1 PubMed概述

PubMed是循证中医药研究证据检索环节的一个重要外文数据库,该库是美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于Web的免费生物医学文献检索系统,学科范畴涉及生物医学各方面,文献量超过240余万篇,检索途径多(有基本检索、高级检索、主题词检索、期刊检索等),检索功能强(具有自动词语匹配功能、主题词检索功能、检索结果多种限定、扩展和加权检索等),检索效果好(有多种方式保障检全率和检准率)。其数据主要来源为MEDLINE,MEDLINE是由美国国立医学图书馆创建和维护的世界上最权威的生物医学文摘数据库,其文献均使用美国国立医学图书馆编制的《医学主题词表》(Medical Subject Heading,MeSH)进行主题标引。

PubMed收录的循证中医药证据有原始研究证据和二次研究证据。原始研究证据是指直接以患者或健康人为研究对象,对相关问题进行研究所获得的第一手数据,经统计学处理、分析、总结而形成的研究报告。相关的文献类型有病例对照研究、病例分析、个案报告、随机对照试验等。二次研究证据是指在全面收集针对某一问题的所有原始研究证据的基础上,经严格评价、整合处理、分析总结而形成的研究报告,比如:系统评价/Meta分析、临床实践指南、临床路径、卫生技术评估、卫生经济学研究等。证据的质量可参照证据分级标准进行评价。

2 PubMed的循证中医药文献检索技巧

PubMed采用MeSH词表进行主题标引,该此表一直在不断增加中医药学方面的主题词,因此,在PubMed的循证中医药文献检索时,不仅可以用关键词检索,还可以采用主题词检索。

2.1关键词检索技巧 关键词检索应该提炼检索课题中有实质意义的词,要把各种英文表达的可能性尽量都考虑进去,中医药的英文译名往往有多个,要考虑汉语拼音名称、英文名称、拉丁文等,比如苍耳子英文就有cangerzi,cangerzi,cangerzi,Cocklebur Fruit,FructusXanthii,XanthiiFructus,the ac

hene of Siberia cocklebur等。

2.2主题词检索技巧 进行主题词检索时,首先要尽可能全面的收集需要检索的中医药名词术语的不同英文表达形式,然后使用这些词在MeSH Database中查找到对应的主题词,并组合相应的副主题词进行检索。比如中医有zhongyi,zhongyixue,Traditional Chinese Medicine,Chinese Traditional Medicine

TCM等,然后通过系统找到相对应主题词为Medicine,Chinese Traditional。对于中药和方剂,在PubMed中一般为补充物质概念(Supplementary Concept),比如小柴胡,在PubMed主题词数据库中检索后发现系统把该词标引为xiaochaihu [Supplementary Concept]。另外PubMed没有诸如《中国中医药学主题词表》针对中医药的副主题词,比如中药疗法、按摩疗法、中医病机之类,因此,PubMed在检索此类概念的时候只能再查找相对应的主题词或者关键词进行检索。

2.3主题词结合关键词检索 在PubMed中检索出中医药主题词后,为了避免漏检(中医药主题词可能会出现漏标或者标引不准确),需要再用关键词补充检索,比如"Acupuncture"[Mesh] 检索到文献1299篇,用Acupuncture[Title/Abstract]可以检索出16470篇,"xiaochaihu" [Supplementary Concept]检索到仅8篇文献,用xiaochaihu OR xiao chai hu可以检索到文献35篇,关键词检索结果与主题词检索结果可以进行逻辑或运算。

3 PubMed的循证中医药文献检索方式

PubMed数据库中主要提供四种方式进行快速而有效的循证中医药文献的检索:①利用检索结果Filter功能;②利用Clinical Queries模块;③askMEDLINE功能;④利用PICO要素检索。

3.1利用检索结果Filter功能进行循证中医药文献检索 PubMed的Filter将文献类型限定为Practice Guideline(实践指南)、Meta-analysis(Meta分析)、 Clinical Trial(临床试验)、Clinical Trial, Phase I(一期临床试验)、Clinical Trial, Phase II(二期临床试验)、Clinical Trial, Phase III(三期临床试验)、Clinical Trial, Phase IV(四期临床试验)、Systematic Reviews(系统评价)、Controlled Clinical Trial(临床对照试验)、Case Reports(病例报告)、Randomized Controlled Trial(随机对照试验)、Multicenter Study(多中心研究)、Pragmatic Clinical Trial(实效性临床试验)、Comparative Study(比较研究)等即可获得相关特定文献类型的循证中医药文献。具体检索方法是在PubMed检索结果界面对检索结果进行Filter限定,例如检索针灸应用于青光眼的系统评价,检索式见表1(检索时间为2015年11月13日)。

表1的检索式中#1~#9检索的是针灸相关的文献,其中#1~#5采用针灸相关的主题词检索,#6~#8采用的是针灸的相关关键词检索,为了提高文献检准率,限定在题名或摘要字段中检索,#9对前八项检索结果进行逻辑或,得到了针灸相关的所有文献。#10检索的是青光眼做主题词的文献,并对其下位主题词进行扩展检索,#11~#13检索的是青光眼相关的关键词在题名或摘要中出现文献,#14对#10~#13进行了逻辑或运算,得到了青光眼相关的所有文献,#15再将针灸相关文献和青光眼相关文献进行逻辑与运算,检索结果为针灸应用于青光眼的文献,#16将针灸应用于青光眼的文献类型限定为Systematic Reviews,即实现了针灸应用于青光眼的系统评价文献的检索。同理,若需检索随机对照试验的文献,在最后一个步骤Filter文献类型限定为Randomized Controlled Trial即可,若需同时检索几种文献类型的文献,比如检索针灸应用于青光眼的系统评价或Meta分析文献,只需在文献类型限定中同时选中Systematic Reviews和Meta-Analysis,此方式的优点有:可与基本检索、高级检索、主题词检索结合进行检索,检全率和检准率有保障,可根据实际需要灵活选择各种不同文献类型。

3.2利用Clinical Queries模块进行循证中医药文献检索 PubMed数据库的Clinical Queries模块专为临床医生设计,可检索Clinical Study Category(临床研究)以及Systematic Review(系统评价)。其中Clinical Study Category主要提供临床的原始研究文献,可选择病因、治疗、诊断、预后、临床预测五方面进行浏览,Systematic Review则供检索疾病的系统评价、Meta分析、临床试验综述、指南等方面的文献,为二次研究证据。

若用此法查找针灸应用于青光眼的循证中医药文献,可以在检索框输入"(Acupuncture[tw] OR Electroacupuncture[tw] OR Acupoint*[tw])AND Glaucoma*[tw]",点击Search后,在Clinical Study Category得到12篇临床文献,可选择治疗、预后等类目进行浏览,在Systematic Review中则直接返回命中的4条相关系统评价、meta分析等二次文献。此方法的优点是检索出的都是临床循证医学相关文献,但是此检索只提供一个检索框,适合检索式相对简单的检索。

3.3利用askMEDLINE功能检索 askMEDLINE原为PubMed手持终端应用,也可在PC上检索,网址为http://pubmedhh.nlm.nih.gov/。该法直接输入临床问题,选择文献类型,点击提交即可,其中文献类型有临床试验、Meta分析、随机对照试验、系统评价或综述、实践指南这几类涉及循证医学方面的文献。例如针灸应用于青光眼的文献,可以直接输入口语化的临床问题"use acupuncturefor glaucoma"或者"acupuncture forglaucoma"等,提交问题之后选择系统评价可得到46条结果,选择临床试验有51条结果,选择Meta分析有25条结果。该方法的优点是不需要考虑太多检索技巧,直接用自然语言表达的问题进行检索,并且检索结果相对较多。

3.4利用PICO功能检索 PICO检索也为PubMed手持终端应用,可在PC机上检索,网址同askMEDLINE。该法需要将临床问题分解为循证中医药的PICO四要素,依据PICO四要素进行检索。P为Patient/Problem(患者人群或临床问题),I为Intervention(治疗、诊断等),C为Compare(对照,可无),O为Outcome(结局,可无),还可选择文献类型,选项有临床试验、Meta分析、随机对照试验、系统评价、综述、实践指南。若检索针灸应用于青光眼的系统评价文献,利用PICO检索可为:P为Glaucoma,I为Acupuncture,文献类型限定为Systematic Reviews,可以检出4篇系统评价。应用此法的前提是正确的将循证中医药临床问题分解PICO要素,输入相应检索框即可简便的进行检索。

4 结语

文章所述四种检索方法都是在PubMed检索循证中医药文献比较行之有效的办法,法1利用检索结果的文献类型Filter功能可灵活满足循证中医药研究对不同研究文献的特定需求,同时又能结合基本检索、高级检索和主题词检索功能,可运用多种检索规则和技巧,较好的保障检全率和检准率;法2、法3和法4各有针对性,检索较简单,检索技巧较法1少,在选择时,若要一次性获得相关的原始研究证据和二次研究证据,并且将两者分开显示,则可以运用法2即Clinical Queries模块检索,若不想考虑太多的检索技巧,利用自然语言进行检索,可以采用法3即askMEDLINE检索,若遇到的循证中医药问题能分解出比较明确的PICO要素,可以采用法4即PICO检索。

参考文献:

[1]Sackett D L,Richardson WS,Rosenberg W,et al. Evidence-Based Medicine:How to Practice and Teach EBM[M].2nd ed.London:Churchill Livingstone,2000.

[2]刘建平.传统医学证据体的构成及证据分级的建议[J].中国中西医结合杂志,2007,27(12)∶1061-1069.

编辑/蔡睿琳

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