当前位置:无忧公文网 >范文大全 > 征文 > 荧光定量PCR法检测邻苯二甲酸酯的研究

荧光定量PCR法检测邻苯二甲酸酯的研究

时间:2022-04-07 10:58:21 浏览次数:

摘要:建立了一种利用外切酶保护-荧光定量PCR检测环境激素邻苯二甲酸酯的方法。将从鱼肝脏中提取含雌激素受体的细胞溶质,与不同浓度的邻苯二甲酸酯结合,采用常规PCR方法扩增制备双链结合DNA,将其与配体-受体复合物反应的结合物,用核酸外切酶ExoⅢ和S1核酸酶处理,消解游离DNA,并以消解后产物作为模板,进行荧光定量PCR扩增反应,建立Ct值与邻苯二甲酸酯质量浓度C(g/L)的对数标准曲线:Ct=-0.273 lg(C)+6.320。将该方法应用于水样中邻苯二甲酸酯的检测,最低检测限达到10~100 μg/mL。该法准确度高、抗干扰性强、适用于检测大批量环境样品中邻苯二甲酸酯。

关键词:邻苯二甲酸酯;荧光定量PCR;核酸外切酶

中图分类号:X826;X56文献标识码:A文章编号:0439-8114(2012)04-0823-04

邻苯二甲酸酯(Phthalates)是塑料的增塑剂,用于增大产品的可塑性和提高产品的强度[1]。随着塑料工业的迅速发展和塑料制品的广泛应用,这类污染物已大量进入环境,普遍存在于土壤、底泥、水体、生物、空气及大气降尘物等环境中[2,3],对环境的不利影响也逐渐凸显。研究表明,邻苯二甲酸酯具有急性毒性、致癌性和致畸性等多种生物毒性[4-6],而且邻苯二甲酸酯水解和光解速率都非常缓慢,已成为一种全球性的环境有机污染物,被中国环境检测总站和美国EPA列为优先控制污染物[7]。

目前,邻苯二甲酸酯的检测方法包括:气相色谱法[8]、液相色谱法[9]、气相色谱-质谱联用法(GC-MS)[10]以及荧光法[11]等。由于这类方法检测成本高,操作复杂,分析时间长,因此不利于对环境样品的快速分析。

近年来,随着生物技术的发展,利用具有高灵敏度的聚合酶链式反应(PCR)检测技术检测邻苯二甲酸酯正逐渐受到关注。目前,PCR技术主要用于检测邻苯二甲酸酯的雌激素效应[12-15],而直接用于检测环境样本中邻苯二甲酸酯含量的研究报道较少。

邻苯二甲酸酯作为雌激素受体的配体,能够与雌激素受体结合并能诱导雌激素受体介导的基因表达,其作用过程为:邻苯二甲酸酯与细胞膜或细胞质中的雌激素受体结合,然后这种结合体迁移到细胞核并与核内DNA上雌激素反应位点结合,上行调节雌激素响应基因的转录和翻译,翻译产物蛋白质进入相应的靶组织或靶器官,从而引起雌激素效应[16]。根据此原理,建立检测邻苯二甲酸酯的核酸外切酶保护-荧光定量PCR分析方法。用邻苯二甲酸酯诱导雌激素受体与特异性的双链DNA结合,游离的DNA被S1核酸酶降解,以酶切产物作为模板,进行荧光定量PCR反应。由于传统的酶切保护分析方法[17]灵敏度低,假阳性率高。本试验在传统酶切保护基础上,进一步利用S1核酸酶完全切除ExoⅢ酶切后留下的单链,使游离的DNA不能被扩增,并结合SYBR Green I荧光定量PCR技术对水样中PAEs含量进行检测。

1材料与方法

1.1试剂

邻苯二甲酸二甲酯,PCR试剂盒,SYBR Green I PCR mix,核酸外切酶ExoⅢ,S1核酸酶,其他试剂均为国药集团化学试剂有限公司生产。

主要实验仪器包括UV-2000紫外分光光度计、Rotor-gene 3000荧光定量PCR仪、DYY-11型电泳仪(北京市六一仪器厂)、Tanon-2500R数码凝胶图像处理系统(上海天能科技有限公司)。

1.2引物设计

利用primer premier 5.0引物设计软件设计含有雌激素反应位点的上下游引物,由上海英骏生物科技有限公司合成。引物序列如下:上游引物R1: 5′CAG GTC AGA GTG ACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′;下游引物R2: 5′GTC CAG TCT CAC TGG ACA GGC AAC TAT GGA TG 3′。下划线标明了雌激素反应位点,模板为稀释50倍后的pUC19质粒[18]。

1.3方法

1.3.1含有受体细胞溶质的提取取体长为12 cm左右的鲤鱼(20尾),用含0.05 mg/L的邻苯二甲酸酯的水喂养两周后,取鱼肝脏,用冰上预冷的0.15 mol/L氯化钾溶液去除肝脏外血液后,吸干其表面水分,按照m(肝脏,mg)∶v(缓冲液,mL)=1∶4的比例加入HEDG缓冲液(冰上预冷)后匀浆。匀浆液于12 000 r/min离心1 h,收集上清,即为含有雌激素受体的细胞溶质,分装后于-80 ℃保存备用。

1.3.2 结合DNA的制备每50 μL扩增体系中包含:灭菌双蒸水36 μL、pUC19质粒模板工作液2 μL、10倍PCR缓冲液5 μL、10 mmol/L的四种核苷酸的混合物(dNTPs)1 μL、上下游引物(10 μmol/L)各2 μL、2 U/μL Taq酶2 μL。常规PCR循环步骤:预变性94℃、5 min;变性94 ℃、30 s;退火58 ℃、40 s;延伸72 ℃、40 s;循环30次,最终延伸72 ℃、5 min。PCR产物于质量分数为1%的琼脂糖凝胶电泳分离,用PCR产物快速纯化试剂盒纯化回收。

1.3.3配体-受体-结合DNA复合物的制备与酶切将1 g/L的PAEs按10倍比稀释为1.0×10-1 g/L~1.0×10-9 g/L,各取10μL,加入细胞溶质250 μL,于20 ℃振荡温育2 h。加入0.2 mL质量分数为60%的羟基磷灰石(HAP)混匀,冰浴30 min, 在4℃以3 500 r/mim离心1 min,弃上清。上述沉淀中加入1 mL含质量分数为0.05% T-80的HEDG缓冲液,同条件离心15 min,重复3次,最后1次弃上清,加入0.2 mol/L的磷酸缓冲液0.4 mL,间歇振荡3次,离心15 min,取上清,即为配体-受体复合物。

从上述不同浓度配体-受体复合物中,每管取出20 μL于1.5 mL小管中,加入2 μL结合DNA,继续20℃温育15 min,此时溶液中为配体-受体-结合DNA复合物。

酶切步骤:从上述配体-受体-结合DNA复合物中各取12 μL于1.5 mL小管中,加入2 μL ExoⅢ核酸外切酶缓冲液,6 μL Hepes缓冲液,使总体积为20 μL,混匀后37℃温育15 min;每管再加入ExoⅢ 100 U,混匀后于37℃温育15 min;按照体积比为1∶3的比例,加入S1核酸酶(2 U/μL)混合液,37℃温育30 min;再各加入4 μL S1核酸酶终止液,70℃灭活10 min,得到荧光定量PCR的模板。

1.4荧光定量PCR条件

每20 μL体系中包含SYBR Green I Master mix 10 μL(MgCl2最佳质量浓度为2 μmol/L)、上下游引物(10 μmol/L)各1 μL、配体-受体结合DNA复合物酶切产物作为模板2.5 μL、灭菌双蒸水5.5 μL。荧光定量PCR循环步骤:94 ℃预变性5 min,94 ℃变性30 s,58℃退火40 s,72℃延伸1 min,循环40次,最后在72 ℃延伸5 min。

2结果与分析

2.1结合DNA的凝胶电泳分析

常规PCR扩增后产物于质量分数为1%的琼脂糖凝胶电泳分析(图1)。结合DNA为长度1 024 bp的双链DNA,与设计的双链DNA长度相符。用PCR产物快速纯化试剂盒纯化回收后,用紫外分光光度法测得OD260 nm/OD280 nm值为1.86,表明回收DNA纯度高。

2.2配体-受体复合物的SPR鉴定

表面等离子体共振(Surface plasmon resonance,SPR)技术具有免标记、实时在线检测、高灵敏度、非破坏性及高选择性等优点[18]。本试验采用SPR定性鉴定雌激素受体蛋白与邻苯二甲酸酯结合情况(图2、3)。

随着复合物中加入邻苯二甲酸酯配体浓度的增加,配体-受体复合物的SPR响应强度增强。在加入邻苯二甲酸酯浓度在1.0×10-9~1.0 g/L范围内,邻苯二甲酸酯配体浓度与受体-配体复合物的SPR响应强度之间基本呈线性关系。说明在此浓度范围内,加入含雌激素受体的细胞质为250 μL时,邻苯二甲酸酯可与雌激素受体结合。

2.3不同浓度邻苯二甲酸酯诱导结合DNA的SYBR Green I荧光定量PCR

以不同浓度的邻苯二甲酸酯制备的配体-受体-结合DNA复合物,经过外切酶保护处理,作为荧光定量PCR模板进行扩增,扩增曲线见图4和图5。邻苯二甲酸酯配体质量浓度C(g/L)对数与Ct值具有线性关系,两者关系式为Ct=-0.273*log(C)+6.320,R2=0.994 8,本方法对邻苯二甲酸酯的检出限为10-10 g/L,在低浓度水平下,Ct并未出现显著变化。

本试验的受试水样来源于松江东华大学北侧的张家浜河河水,样本经过预处理后进行检测,结果如图6所示,其线性检测范围为10~100 μg/mL。

2.4特异性分析

将多氯联苯和双酚A代替邻苯二甲酸酯后,按1.4中所述方法进行荧光定量PCR扩增,未发现扩增信号,表明多氯联苯和双酚A并没有与受体结合,而邻苯二甲酸酯能与受体结合,说明此方法特异性较好。

2.5加标回收分析

用不含邻苯二甲酸酯的水样进行加标回收试验。加标回收结果见表1。由结果可知,回收率为81.6%~97.6%,相对标准偏差为2.69%~4.45%。由表1可以看出,本文建立的外切酶保护-荧光定量PCR方法准确度高,可以较好地应用于环境中邻苯二甲酸酯的检测。

3结论

建立了一种利用外切酶保护-荧光定量PCR检测方法,用S1核酸酶完全切除核酸外切酶ExoⅢ酶切后留下的单链,使游离DNA完全不能被PCR扩增出来,提高了灵敏度。以配体-受体-DNA复合物为模板进行PCR扩增,当配体-受体-DNA复合物中加入的邻苯二甲酸酯质量浓度在10-9~10-1 g/L范围内时,邻苯二甲酸酯对数浓度与Ct值线性关系为Ct=-0.273lg(C)+6.320。水样样本的检测范围达10~100 μg/mL。该方法可同时处理多个样品,且灵敏度高,准确性好,抗干扰性强,检测过程仅2~3 h,为高通量快速检测环境样品中的邻苯二甲酸酯提供了新方法。

推荐访问: 定量 荧光 检测 二甲酸 研究