开放性科学研究体系，不断提升国家级自然保护区科学研究水平和综合管理能力，为建设“国内外具有较大影响，具有示范性、引领性的现代化国家级自然保护区”的总目标提供了有效科技支撑。
随着计算机技术、网络技术和通信技术的发展和应用，近年来上海崇明东滩鸟类自然保护区管理处紧紧围绕构建“智慧东滩”的发展目标，以视频监控系统和地理信息系统开发建设为抓手，大力开展信息化技术在自然保护区保护管理中的应用开发，借助信息化手段促进自然保护区科研、巡护、监测、执法和教育等工作的整合和融合，不断提高保护区信息化建设和管理水平，促进自然保护区管理现代化。
进行自然保护的宣传教育也是自然保护区法定职责之一。上海崇明东滩鸟类国家级自然保护区自建区以来，以建设“国内外具有较大影响，具有示范性、引领性的现代化国家级自然保护区”为总目标，以提升公众自然保护意识和生态文明意识为己任，紧紧依托独特的自然资源和生态系统，不断完善科普教育基础设施，不断创新科普教育宣传方式，努力构建科普教育交流合作平台，积极面向广大中小学生和社会公众开展形式多样的科普教育活动，增进了社会各界对自然保护、湿地保护和迁徙物种保育的科学认识，有力地推动了崇明东滩鸟类国家级自然保护区各项事业可持续发展。保护区于2008年被上海市科协评为“上海市科普教育基地”，2010年被中国科协评为“全国科普教育基地”。
12月19日，国家林业局局长赵树丛参观了崇明东滩及保护区鸟类科普教育基地后表示，崇明东滩保护区在管护执法、科普教育、外来入侵物种生态治理和鸟类栖息地优化方面做了很多工作，成效显著。崇明东滩保护区要进一步发挥自身优势，加强资源保护，科学合理规划，为鸟类营造更多的优质栖息环境，为促进人与自然和谐发展做出更大的贡献。
“白浪茫茫与海连，平沙浩浩四无边。暮去朝来淘不住，遂令东海变桑田。”崇明东滩，用科技筑建和谐的净土，美丽中国需要心灵的守护。